Собрать несколько видеофайлов в один

Используя mencoder, собрать несколько AVI-файлов:

sudo apt-get install mencoder

mencoder 1.avi 2.avi 3.avi -oac copy -ovc copy -o out.avi

Если у нас несколько файлов формата MOV, переведем их сначала в AVI, например, с помощью ffmpeg:
sudo apt-get install ffmpeg
for i in *.MOV; do ffmpeg -i "$i" -vcodec mpeg4 -b 480k -r 23.976 -acodec libmp3lame -ab 96k -sameq -pass 1 ${i%MOV}avi; done

Теперь соберем все AVI в один:

sudo apt-get install transcode-utils

avimerge -o out.avi -i *.avi